SMA Genetik Taramanın Yeni Yolu

Çin'deki araştırmacılar, spinal müsküler atrofinin (SMA) genetik teşhisi için hızlı ve güvenilir bir yol geliştirdiklerini ve bunun hastalığı olmayan ancak yine de çocuklarına geçirebilen taşıyıcıları tespit ettiğini bildirdiler. Kütle spektrometrisi-kopya sayısı varyasyonu veya MS-CNV olarak adlandırılan yeni yöntemin, iki bağımsız numune grubunda altın standart multipleks ligasyon probu amplifikasyonu (MLPA) yöntemi kadar etkili olduğu bulunmasına karşın sonuç sağlamak için önemli ölçüde daha az zaman gerektiği bildirildi. "Spinal müsküler atrofi genetik testi için MALDI-TOF kütle spektrometrisi ile SMN1 ve SMN2 kopya numaralarının eşzamanlı ölçümü" bulguları Clinica Chimica Acta dergisinde yayınlandı. Neredeyse tüm SMA vakaları, SMN1 geninin her iki kopyasındaki ekson 7'nin tamamen kaybından kaynaklanır ve bu hastalarda aynı anda ekzon 7 ve 8'in kaybı da yaygındır. Eksonlar, bir genin protein üretmek için gerekli bilgileri içeren bölümleridir. Bir yedek SMN geninin kopya sayısı, SMN2, SMA şiddetini etkilemekte ve daha yüksek bir sayı tipik olarak daha az şiddetli hastalığı tahmin etmektedir. SMN1 ve SMN2 arasında ekson 7 ve 8'de tek bir nükleotid farkı vardır. SMN1 geninin her iki kopyasında ekson 7 ve ekson 8 kaybının saptanması, bir SMA tanısını taramak ve doğrulamak için etkili bir yol iken, yalnızca bir mutasyona uğramış gen kopyasının varlığı taşıyıcıları tanımlayabilmektedir. Etnik kökenlerde her 40 ila 50 kişiden biri olan bu taşıyıcılar, hastalıktan etkilenmezler, ancak hatalı geni çocuklarına geçirebilirler. Aile planlaması yapan yetişkinlere uygun genetik danışmanlık için taşıyıcıların belirlenmesi esastır.

Geliştirilen yeni yöntem, taşıyıcı taramasını ve SMA'nın erken teşhisini büyük ölçüde kolaylaştırabilir

Son birkaç yılda yenidoğan ve taşıyıcı SMA taraması için çeşitli yöntemler geliştirilmiştir. Araştırmacılar, onaylanmış SMA tedavilerinin mevcudiyeti ve daha erken teşhis ve tedavi ile daha iyi sonuç alma eğilimi göz önüne alındığında, makul bir maliyetle SMN1 ve SMN2 kopya numaralarının eş zamanlı nicelleştirilmesini sağlayan yüksek verimli bir yöntemin SMA'nın yönetimini büyük ölçüde kolaylaştırabileceğini düşündüklerini belirttiler. Bunu akılda tutarak, büyük ölçüde Wenzhou Tıp Üniversitesi'ndeki bir araştırma ekibi, MS-CNV adlı SMA yenidoğan ve taşıyıcı taraması için rekabetçi PCR ve MALDI-TOF kütle spektrometrisi olarak adlandırılan iki tekniği birleştiren yeni bir yöntem geliştirdi. Bu tahlil, hem SMN1 hem de SMN2 genlerindeki ekson 7 ve 8'in kopya sayısının yanı sıra yakındaki NAIP genindeki ekson 5'in eş zamanlı olarak belirlenmesine olanak tanımaktadır. MS-CNV'nin başlangıçta 20 DNA örneğinde SMN1, SMN2 ve NAIP'nin iki kopyasını doğru bir şekilde saptadığı ve aynı örnekler farklı tarihlerde yeniden test edildiğinde sonuçların tekrarlanabilir olduğu bulundu. Yöntem daha sonra, paralel olarak çalışan multipleks ligasyona bağlı prob amplifikasyonu veya MLPA testleri olan iki bağımsız SMA hastası, taşıyıcı ve sağlıklı birey grubundan alınan numunelerde doğrulandı. SMA taraması için altın standart yöntem olan MLPA, genlerin ve bireysel ekzonların kopya sayısını değerlendirmektedir.

 İlk grup 79 kan örneğini içermekle birlikte üçü SMA hastalarından, beşi bilinen taşıyıcılardan ve 71'i bilinmeyen SMA genetik bilgisi olan sağlıklı gönüllülerden olduğu bildirildi. Hem MS-CNV hem de MLPA kullanan sonuçların, SMN1, SMN2 ve NAIP gen kopya sayıları için yüksek derecede uyumlu olduğu gözlendi. Araştırmacılar bir çocuk hastanesinden toplanan 62 kan örneğinden oluşan ikinci grubun daha önce MLPA ile test edildiğini, ancak örnekleri MS-CNV ile analiz ettiklerinde genetik durumları hakkında hiçbir bilgiye sahip olmadıklarını bildirdiler. MLPA'ya benzer şekilde, MS-CNV yöntemi 21 SMA hastasını, 14 SMA taşıyıcısını ve 27 taşıyıcı olmayanı tanımladı. Bu bulgular, MS-CNV'nin doğruluğu ve yüksek örnek işleme verimi göz önüne alındığında, hem SMN1 hem de SMN2 için dozaj bilgisi sağlayarak, SMA'nın taşıyıcı taraması ve genetik teşhisi için kullanılabileceğini vurguladı. Ekip, SMN1 ve SMN2 gen kopya sayılarının nicelleştirilmesine yönelik bu yüksek oranda otomatikleştirilmiş yöntemin, taşıyıcı taramasını ve SMA'nın erken teşhisini ve ayrıca etkili tedavi için uygun hastaları belirlemeyi büyük ölçüde kolaylaştırabileceğini ifade etti.